百合种子有子叶出土和子叶留土两种类型，子叶出土的播种后10～30天子叶出土，如百合、王百合、闽台百合等，而湖北百合需30天以上才能发芽。子叶出土类百合播种时间以春季为好，覆土厚度为1～2厘米，部分品种培养6个月后即可开花，王百合需14个月才能开花。子叶留土的种类在温暖地区以秋播为宜，入冬前抽出胚根，第2年春季第1片真叶出土，3～4年后才能开花。子叶留土的种子在土中形成越冬小鳞茎，到第2年春天才由小鳞茎内长出第1片地上部的真叶，如毛百合、青岛百合、东北百合、药百合等，这类种子应采收后当年秋季播种。如果幼苗移栽，应在子叶刚出土表至子叶伸直时进行。一般认为，20℃恒温是百合种子萌发的适宜温度。20℃恒温时，野生细叶百合种子在避光下萌发率，为90%左右。光照对细叶百合种子的萌发有一定抑制作用，萌发率比避光有所降低，大约降低10%左右。
百合种类较多，繁殖时可根据不同种类，采取适宜的措施，常见的有以下几种方法： 播种法：种子采后即播，也可至第二年春再播。幼苗期要进行遮阳，并加强水肥管理，到秋天就可形成小鳞茎。开花时间因百合的种类不同而异，像百合一年就可开花。 分植小鳞茎：母株在地下茎节上形成小鳞茎，有时在母株球的基部也能形成小鳞茎，秋季将其与母株球分离，另行栽植或沙藏至第二年春再种。栽时宜深，均经20天即可发芽，1至3年开花。 分珠芽：此法仅适合有珠芽的卷丹和沙紫百合。于夏秋时节，将成熟的珠芽采集后进行点播，当年可形成小鳞茎，翌年春萌发出土，秋天再掘起分栽，3年后多数可开花。
鳞片扦插法：此法可用于中等数量的繁殖。秋天挖出鳞茎，将老鳞上充实、肥厚的鳞片逐个分掰下来，每个鳞片的基部应带有一小部分茎盘，稍阴干，然后扦插于盛好河沙（或蛭石)的花盆或浅木箱中，让鳞片的2/3插入基质，保持基质一定湿度，在20度左右条件下，约1个半月，鳞片伤口处即生根。冬季湿度宜保持18度左右，河沙不要过湿。培养到次年春季，鳞片即可长出小鳞茎，将它们分上来，栽入盆中，加以精心管理，培养3年左右即可开花。
分小鳞茎法；如果需要繁殖1株或几株，可采用此法。通常在老鳞茎的茎盘长有一些小鳞茎。在9-10月收获百合时，可把这些小鳞茎分离下来，贮藏在室内的砂中越冬。第二年春季上盆栽种。培养到第三年9-10月，即可长成大鳞茎而培育成大植株。此法繁殖量小，只适宜家庭盆栽繁殖。
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